Épisode 1 : Origines I

Cortana, l'intelligence artificielle avancée qui acompagne le Major a emagaziné et assimilé suffisamment d'informations afin de pouvoir retracer l'histoire des Forerunners et de l'humanité.
Les Forerunners étaient un peuple exemplaire de sagesse et de droitesse. Mais un jour, ils sont menacés par les mystérieux parasites nommés "Flood" qui se logent dans le corps des êtres vivants ayant un minimum de masse cérébrale pour se reproduire. Les Forerunners se sont battus de toute leur force contre cette invasion mais en vainc. Ils ont alors eu recours à une ultime arme qu'ils ont mise au point pour exterminer les parasites: les Halo. Ces anneaux destructeurs propagent des ondes qui tuent tout être vivant suceptible de constituer une source de nourriture pour les parasites. Ainsi, d'innombrables formes de vies sont décimées à travers la galaxie, à commencer par les Forerunners eux-mêmes, et la menace Flood est annihilée. Cependant, avant de mettre leur plan à éxécution, ils ont conservé des specimens de chacune des espèces contre lesquelles ils ont été obligés de commettre un génocide, humains et Covenants parmi elles, mais ils n'ont pas pu en faire de même pour leur propre espèce. Une fois les parasites éradiqués, des intelligences artificielles créées par les Forerunners se sont chargées de repleupler les milliers de planètes affectées par un Halo. C'était il y a cent mille ans et depuis, l'humanité a commencé et poursuivi son évolution...