Épisode 13: Shirley et l'arme

Lelouch et ses camarades assistent à l'enterrement du père de Shirley. Malgré lui, il reste très perturbé par le chagrin de Shirley et en vient même à douter de ses propres actions. Mais C.C. le provoque en le traitant de faible et de puérile. Lelouch retrouve alors toute sa détermination.
La nouvelle mission de l'Ordre des Chevaliers Noirs consiste à capturer Cornelia qui est sur le point d'arrêter le général Takase du Front de Libération du Japon qui se trouve au port.

Pendant ce temps, Viletta a mené son enquête seule et place Lelouch en première liste de ses suspectés d'être Zéro. Elle est allée rencontrer Shirley en lui demandant des informations sur Lelouch et en lui révélant qu'elle le soupçonne d'être Zero. Shirley n'arrive à croire que Lelouch soit Zero mais elle va pourtant le suivre après la sortie des cours, discrètement filée par Viletta. Shirley perd la trace de Lelouch dans le dédale des hangars du port.

Lelouch, ou plutôt Zero, aux côtés des autres Chevaliers Noirs, attend que les forces de Cornelia attaquent le paquebot de Takase et se mettent à découvert. À ce moment, Zero fait exploser du liquide de Sakuradite sur les forces du Front de Libération du Japon afin de surprendre et semer le trouble dans les soldats britanniens. Il arrive avec Kallen à acculer Cornelia mais il est troublé quand il repère de loin Shirley. Cette seconde d'hésitation permet à un Knightmare de venir en soutient à Cornelia: le Lancelot. Susaku Kirihara a été envoyé au casse-pipe pour cette bataille. Cornelia affronte Kallen tandis que Suzaku se bat contre Zero. Mais Zero, peu expert en combat à bord d'un Knightmare, se fait vite battre. Kallen réussit à esquiver Cornelia et arrête Suzku avant qu'il n'achève le Knightmare de Zero.
Shirley s'approche de Zéro, désireuse de venger son père mais terrifiée à l'idée de découvrir qui se cache derrière le masque de Zéro...