Épisode 1 : L'école va fermer !

Mikan, l'héroine fait une manifestation car son école va être fermée. Cet évènemùent n'a pas l'air de déranger les autres élèves bien au contraire.
L'école c'est un lieu chargé de souvenirs, notament celui de... Hotaru, une petite génie, dont le sujet préféré est notament les nanotechnologie. Pas mal pour une petite fille
Très vite ces deux petites sont devenus les meilleurs amies du monde.
Mais Hotaru a dû quitter la campagne pour Tokyo, dans le but d'y intégrer la Gakuen Alice, une école pour génie.
Après 9 longs mois de séparation, Mikan décide de se rendre elle aussi à Tokyo pour retrouver son amie.
Arrivée à l'école, elle manque de se faire kidnapper, mais un professeur au physique convaincant réussi à la sauver.
Le prof repère en Mikan un pouvoir magique, mais il ne sait pas encore lequel. Elle pourra donc intégrer l'école et revoir son amie.
Le mur de l'enceinte explose, c'est une tentative d'évasion. Un garçon à la tête de chat apparaît....