Épisode 1 : Coppelion

Naruse, Aoi et Taeko arpentent Tokyo, en ruines, à la recherche de personnes s'y trouvant. Mishima Onihei, le principal de leur lycée et aussi colonel des forces de défense, a repéré un SOS radio et leur ordonner de trouver la source mais sans agir.
Les filles passent sur un grand pont passant au-dessus du fleuve et s'arrêtent pique-niquer. Mais Narusa se transfuse ce qu'elle a besoin comme nutriment par piqûre, ce qui vexe Aoi qui savoure d'autant plus son repas.
Soudain, elles captent le signal d'un homme en combinaison de la tête aux pieds agonisant au sol et envoient une alerte à leurs supérieurs. Contre les interdits, Narue lui administre des premiers soins avec une injection d'Aether. Mishima, une fois sur place la réprimande pour avoir utilisé une dose pour un homme quasiment condamné alors que leurs stocks sont limités mais elle s'énerve et lui rétorque qu'ils n'ont qu'à en produire plus.
Les trois filles, des enfants génétiquement modifiés désignés sous le nom de Coppelion, qui peuvent respirer sans casque, poursuivent leur chemin dans la ville tandis que Mishima repart avec le souffrant. Elles constatent que plusieurs animaux peuvent vivre dans la ville. Les filles se rendent vers l'épicentre de la ville, la zone la plus contaminée entourée en journée par un épais brouillard toxic. Mais un chien les a suivies. Taeko reste pour lui parler et faire en sorte qu'il ne les suive plus. Ayant de l'adn animal, elle possède en conséquence une empathie animale prononcée.

Dans l'hélicoptère, Mishima se rapproche de l'épicentre et s'introduit dans la zone pendant le court instant où le brouillard se dissipe. Il filme alors la ville dévastée, dont les images sont retransmises en direct à la télévision japonaise pour sensibiliser les citoyens sur cette grande catastrophe qui a dévasté le pays et qui s'est déclenchée à Tokyo.

Naruse et Aoi ont avancé, elles trouvent le cadavre d'un homme mais elles sont font attaquer peu après par un loup. Elles se rendent compte que la faune est retournée totalement à la vie sauvage et se mettent à s'inquiéter pour Taeko, d'autant qu'elle ne répond pas à son talkie-walkie.